1．病原微生物功能基因组学、蛋白质组学、致病性和遗传变异与功能获得性微生物组学研究；
2．病原微生物的耐药性及医院内感染控制、分子生物学及检验诊断新技术、新方法研究；
3．新发和再发传染病的病原学、病理学、免疫学基础与应用、流行病学与预防学研究；
4．感染免疫、病原与宿主互作用、病原的免疫保护或免疫逃逸等相关基础研究与应用研究；
5．免疫相关性疾病、肿瘤免疫、移植免疫、分子免疫等相关基础研究与临床应用研究；
6．新型生物技术药物及疫苗的相关研究、微生物学与免疫学相关转化医学研究；
7．现代生物技术、系统生物学及生物信息在临床微生物及免疫学研究和转化医学中的应用；
8．相关临床病例的病原学、免疫学检验分析与讨论等。