基因组学是一门新兴学科，又是一门发展非常迅速的学科。自1998年人类基因组计划实施以来，随着测序技术的不断探索、发展和成熟，基因组学的发展日新月异，已经渗透到包括工业，农业，能源，生态和人类健康等生命科学领域的各个方面，并显示出强大的发展活力。目前基因组学的发展正面临着从“以大规模测序为目的”到“以大规模测序为手段来解决科学问题”的一个转型。1998年时，美国计划以十年时间来完成人类全基因组测序,现在一个测序中心在一个月内就可以完成此任务。测序技术的发展使基因组学面临的最大挑战由如何提高测序通量转变为如何利用新的测序技术来解决重大科学问题。在这个时间节点上，中科院北京基因组研究所联合中国遗传学会基因组学分委会举办2009年国际基因组学大会，邀请国际基因组学的领军机构科学家和科研人员同聚一堂，共同探讨基因组学发展的方向。