近年來各國的東南亞研究再度燃起了對本區域長久以來的高度混合性、流動性與創新性的興趣，而致力於超越今日既有國家框架，以挖掘跨界的歷史連帶、社會文化變遷、政治革新、與經濟制度。比如探討自十三世紀以來海洋東南亞與阿拉伯半島逐漸共構的伊斯蘭知識份子共同圈(Laffan 2011)，或是鑽研早期紀載而提出的前現代東南亞之性別多元論(gender pluralism) (Peletz 2009)；又如詳實記載印尼穆斯林融合中東與歐美思潮而促成以穆斯林為多數的民主化政體的歷史過程(Hefner 2000)，及描述加里曼丹森林的命運如何繫於北美投機商、印尼政客、當地人與環保運動者的共謀與背叛之上(Tsing 2004)；跨越時空而將大陸東南亞高地人群長期對抗國家機制概念轉化為Zomia文化地理區 (Scott 2004)，乃至於解構從中國到東南亞之「經濟特區」所隱含的「亞洲風」新自由主義(Ong 2005)。這些二十一世紀的重要研究皆兼具了長時性、超越國界的視野並做出跨學科的示範，而台灣的東南亞研究也期待奠基在過去二十年的耕耘中繼續貢獻其發現。 我們鼓勵具有歷史深度，多元性關照以及「跨界」視野的研究，不只是跨越國界、更是族群、宗教、性別、階級、政黨、語言、文化、世代與理論議題上的跨界。除了繼續重視國家與國家之間的領土爭議對人民的意義之外，我們也特別注目移工的新社會角色、以社群為主的全球自然資源管理運動，以及東南亞作為眾多未來台灣新生代「娘家」之親屬關係探討。我們歡迎任何東南亞區域內的研究課題，但我們鼓勵對多元文化、生物多樣性、多元經濟與多族群間權力關係的著重。