由吴毓林、张礼和、吴厚铭等教授发起，中国化学会于2000年讨论成立化学生物学专业委员会。经批准第一届化学生物学专业委员会于2001年正式成立，挂靠中国科学院上海有机化学研究所，吴厚铭研究员任第一届专业委员会主任，姚祝军等人任副主任，学术秘书由姚祝军兼任。2006年12月按期换届，现待中国化学会正式批复。 在中国化学会化学生物学专业委员会的领导下，目前已成功召开了四届全国化学生物学学术会议，具体情况如下：由浙江大学承办的第一届全国化学生物学学术会议于2001年11月1日至5日在杭州召开，会议组织委员会主席是王彦广（浙江大学），会议学术委员会主席是吴毓林（中国科学院上海有机化学研究所）。由北京大学承办的第二届全国化学生物学学术会议于2002年10月28日至30日在北京召开，会议组织委员会主席是赵新生（北京大学），会议学术委员会主席是张礼和（北京大学）。由湖南大学承办的第三届全国化学生物学学术会议于2004年4月24日至27日在长沙召开，会议组织委员会主席是王柯敏（湖南大学），会议学术委员会主席是张礼和（北京大学）。由武汉大学承办的第四届全国化学生物学学术会议于2005年10月10日至14日在武汉召开，会议组织委员会主席是庞代文（武汉大学），会议学术委员会主席是张礼和（北京大学）。 在第四届全国化学生物学学术会议期间，在多家单位的承办陈述后，经中国化学会化学生物学专业委员会讨论决定第五届全国化学生物学学术会议由中国科学院昆明植物研究所承办，预定于2007年夏季在昆明召开。