会议简介

        近年来,随着现代分子生物学的发展,特别是人类基因组计划的实施,不断产生出巨量的分子生物学数据,这些数据有着数量巨大、关系复杂,以至于不利用计算机根本无法实现数据的存储和分析。生物信息学大量的使用计算机技术进行分析工作,这就要求技术人员熟悉多种分析软件的使用方法及其在生物各领域的应用技术。

       在此次疫情中宏基因组的测序也助力新冠病毒的检测,中科院计算所西部高等技术研究院将在7月4-5举办“宏基因组与R语言数据分析在线直播课”,由北京中科云畅应用技术研究院承办,中科院及权威专家主讲,具体通知如下,欢迎广大相关企事业单位科技工作者,核心技术人员踊跃报名参加!

培训对象:

      大中专院校生物信息、生物计算、生命科学、医学、化学、农学、计算机科学、数学类专业的课程负责人、一线教师、教研室骨干人员、教学管理人员;科研单位从事生物、生命科学、微生物研究的相关人员;生物、医药、化学及相关企业的领导与技术骨干。

主讲专家:

      来自中科院微生物研究所国家重点实验室的高级专家,长期从事生物信息学领域及国家重大项目研究,具有资深的技术底蕴和专业背景。

会议日程

 

 

 

 

 

 

 

 

74日 上午)

宏基因组学介绍一

 

1 16S rDNA AMPLICON SEQUENCING

1.1 测序平台、引物设计及区域选择不同测序平台、针对细菌、 真菌不同微生物实验设计

1.2 测序量及采样建议

针对水体、粪便、土壤、物体表面、口腔等不同生境

1.3 分析流程图

数据收集、数据预处理、数据分析

1.4 结果解析

1.4.1 OTU聚类

1.4.2 物种注释

1.4.3 物种分布情况

1.4.4 样品复杂度分析:α多样性

Coverage   Chao指数   ACE指数

Shannon曲线

Richness rarefaction曲线

1.4.5 多样品比较分析:β多样性

样品间物种丰度热图

排序分析:

PCA分析

PCoA分析

NMDS分析

Unifrac分析

样品聚类分析

2 DSS direct shotgun sequencing)法

2.1 分析流程

2.2 功能注释分析

2.3 代谢途径解析

 

 

74 下午)

 

宏基因组高丰度菌株分析流程介绍

微生物基因组在线圈图分析

代谢通路分析(KEGG & KAAS

病原菌耐药基因鉴定(CARD & Resfinder

细菌基因组岛鉴定 (Islandviewer

进化树软件MEGA使用

 

 

75 上午)

宏转录组学介绍二

宏转录组学介绍

宏转录组学定义

宏转录组研究方法

宏转录组研究内容

宏基因组与宏转录组的差别

 

75 下午)

基于ggplot2程序包的R语言绘图

R语言基本介绍

R语言基本运算、向量函数

3 R语言数据读入以及导出

ggplot2基本绘图 (条形图、散点图、折线图等)

会议商城

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早鸟价

6月7日之前,包含报名费、培训费、资料费

CNY  270.00

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报名

6月7日以后,包含报名费、培训费、资料费

CNY  300.00

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重要日期

  • 会议日期

    07月04日

    2020

    07月05日

    2020

联系我们

  • Ms. 于慧
  • 2797053529@qq.com
  • +86 13691460671

主办单位

  • 中科院计算所西部高等技术研究院

支持单位

  • 北京中科图云科技有限公司 、北京安控冠博科技有限公司

承办单位

  • 北京中科云畅应用技术研究院