时间

课程

主要内容

第一天

Linux 和 Windows 下 Python 语言编写和运行方式

1.Python 的安装

2.Python 的运行

3.IPython notebook 的使用

1.Python 基本语法和数据结构

2.（基于提供的 IPython notebook 同步操作、调试）

3.层级缩进

4.数值的操作

5.字符串的操作

6.列表操作

7.元组操作

8.Range 使用

9.字典操作

Python 输入和输出

1.屏幕输入和输出

2.文件输入和输出

Python 实战练习

1.读写 FASTA 文件

2.读写 FASTQ 文件

3.FASTA 序列格式转换

4.FASTA 序列排序

第二天

回顾第一天的知识

1.提问考核昨天讲过的内容

Python 实战练习

1.FASTQ 序列提取

2.筛选差异基因矩阵

3.转换矩阵格式

4.简化的序列比对程序

Python 正则表达式

1.正则表达式讲解

2.re 模块学习

3.字符串匹配实战

第三天

Python 模块和函数操作

1.理解 Python 的模块和函数

2.Python 模块安装

3.函数写作讲解

Python 函数实战练习

1.第一二天的练习用函数重写，同类功能模块化

Python 命令行参数处理

1.理解命令行参数

2.Python 命令行参数的处理

第四天

 Python 命令行参数实战练习

1.整合命令行参数处理到第三天的程序，使得程序可以处理同类问题

1.Python 矩阵处理模块 Pandas 和画图（Python 像 R 一样处理矩阵和画图）

1.Pandas 库介绍

2.矩阵的合并、提取

3.矩阵统计分析

4.科学绘图 (直方图、箱线图、饼图、密度图、热图)