为了评估城建过程中用地变化对土壤及地下环境生态带来的影响，需要对微生物群落进行调查研究。本研究在上海市某废弃垃圾填埋场钻取五口6m深井，采集了地表及地下土壤、水体样品，测量了它们的理化性质，然后对细菌的16S rRNA基因、amoA基因进行了高通量测序，分析了细菌群落多样性。结果表明，该垃圾填埋场土壤微生物群落多样性主要受土壤层位控制，其中表层样品多样性较高，而深层样品相对贫瘠。不同井之间多样性差异不明显，水平方向较为均匀。填埋场中、深部土壤受氨氮污染较为严重，最高值达到了91.23mg/kg。在土壤样品中，变形菌门（Proteobacteria）是最优势物种，而且占比随着深度的增加而增加。在属水平上，表层土壤中Thiobacillus属，与深部土壤的假单胞菌属（Pseudomonas）等为优势物种。对于amoA基因，表层样品中优势菌群为亚硝化单胞菌属，而深层中为亚硝化螺菌属。相关性分析结果表明，amoA基因丰度与亚硝酸盐浓度显著正相关。研究结果有助于厘清污染场地微生物群落空间分异规律及其影响因素，为相关部门与单位制定土壤修复、再利用计划提供支持。

土壤；微生物；16S；高通量测序；多样性