空间单细胞核代谢组技术SEAM
编号:25 访问权限:仅限参会人 更新:2022-06-28 16:49:34 浏览:385次 口头报告

报告开始:2022年07月23日 17:40(Asia/Shanghai)

报告时间:15min

所在会场:[S5] 分会场5 [S5-1] 单细胞组学技术开发与应用

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摘要

空间代谢组学可以揭示细胞间异质性和组织的形成结构。近期我们开发了一项空间单核代谢组学方法(SEAM) ,这是一个灵活的平台技术,结合了高空间分辨率成像质谱和一组计算算法,可以显示多尺度和多色组织断层扫描,以及通过它们的单核的识别和聚类。在研究中我们首先将 SEAM 应用于一系列野生型小鼠组织,该研究进一步研究了人类纤维化肝脏的空间代谢特征。该研究发现了具有特殊代谢特征的肝细胞亚群,这些特征与它们靠近纤维化生态位相关,并通过使用 Geo-seq 的空间转录组学验证了这一发现。这些演示突出了 SEAM 在单细胞水平上探索空间代谢特征和组织结构学的能力,从而更深入地了解组织代谢组织。相关论文在2021年10月的Nature Methods,同期评论称该技术推动了空间代谢组技术进入亚细胞时代。相关成果入选2021年度中国生物信息学十大进展。

关键词
单细胞组学
报告人
陈阳
研究员 中国医学科学院基础医学研究所

稿件作者
陈阳 中国医学科学院基础医学研究所
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重要日期
  • 会议日期

    07月22日

    2022

    07月25日

    2022

  • 06月15日 2022

    初稿截稿日期

  • 07月05日 2022

    提前注册日期

  • 08月01日 2022

    注册截止日期

主办单位
中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专业委员会
中山大学中山眼科中心
中山大学医学院
南方医科大学
承办单位
中山大学中山眼科中心
中山大学医学院
南方医科大学
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