针对电磁轴承—柔性储能飞轮转子系统的不平衡振动控制,提出一种基于最小均方误差(Least Mean Square,LMS)的自适应变步长算法实现全工作转速范围内的振动控制方法。在标准LMS算法的基础上采用一种新的步长因子迭代公式,基于该步长因子下的LMS算法实时识别转子位移信号中与转速同频的振动分量和与临界转速同频的振动分量,通过反馈对这两个分量进行不平衡补偿,以实现转子的振动控制。将该方法应用于基于有限单元法建立的柔性储能飞轮转子仿真模型中,结果表明,该方法可显著抑制电磁轴承—柔性储能飞轮转子的振动。